1953年1月，内蒙古自治区东部区行政公署成立，科尔沁右翼中旗属内蒙古自治区东部行政公署兴安盟管辖。3月，兴安盟建置被撤销，科尔沁右翼中旗直辖于内蒙古自治区东部区行政公署。1954年5月21日，科尔沁右翼中旗归属呼伦贝尔盟（今呼伦贝尔市）管辖。

1960年7月17日，撤销突泉县行政建制，其行政区域并入科尔沁右翼中旗，旗人民委员会驻地从高力板迁址突泉镇。1962年10月20日，恢复突泉县行政建制，科尔沁右翼中旗人民委员会迁驻白音胡硕镇（原黑庙旧址）。1965年8月24日，科尔沁右翼中旗划归哲里木盟（今通辽市）管辖。1969年7月5日，科尔沁右翼中旗随哲里木盟划入吉林省管辖。1979年5月30日，划回内蒙古自治区仍归哲里木盟管辖。1980年7月26日，兴安盟建制恢复后，科尔沁右翼中旗划归兴安盟行政公署管辖。

1956年，科尔沁右翼中旗辖1个镇、9个努图克、72个嘎查。

1982年，辖1个镇、17个人民公社。

1987年，辖3个镇、16个苏木、5个国营林场、185个嘎查。

1997年，辖20个苏木镇、244个嘎查。

2004年，辖18个苏木镇（管理区）、23个居委会、173个嘎查。

2011年，辖6个镇、6个苏木、2个工作部、26个居委会、173个嘎查。

截至2019年，科尔沁右翼中旗辖6个镇、6个苏木、2个工作部、26个居委会、173个嘎查。