1949年3月25日，乌审旗临时自治委员会成立（设主任），将全旗区域划分为7个区。8月10日，乌审旗人民政府成立（委员会制，设主任、副主任），隶属陕甘宁边区伊克昭盟（今鄂尔多斯市）人民自治政务委员会。1950年春，乌审旗人民政府辖7个区（设区长）、29个行政村（设村主任），隶属绥远省伊克昭盟人民自治政府。1953年，改村划乡，全旗划分为7个区、33个乡。1954年3月，乌审旗隶属内蒙古自治区伊克昭盟人民政府。

1956年，乌审旗人民委员会将全旗行政区域调整划分为1镇、6个苏木、10个乡、2个区。1958年，在“人民公社”化运动中，将全旗区域划分为11个人民公社。1961年，调整为14个人民公社。1983年，乌审旗人大常委会和人民政府在全旗改革“政社合一”体制，以原人民公社的行政区划为基础，分别建立苏木、乡、镇人民政府。1995年，增设查干淖尔镇，相应地建立镇人民政府。